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RIGORMED / SKILLS

Forschungs-Skills

Finde passende Fähigkeiten für deine Forschung – von Literatur bis Manuskript.

150 Skills

Sterne aktualisiert: 04.11.2026
Präsentation und Publikation 73.417

ppt-master

Bearbeitbare PPTX mit nativen Vorlagen, Diagrammen, Folienrekonstruktion und Vertonung erstellen.

PPTPowerPoint
hugohe3
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Literatur und EvidenzIntern

Evidenzrecherche

Sucht öffentliche Literatur zur Forschungsfrage und bewahrt überprüfbare Quellenangaben.

RigorMed
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Wissenschaftliches Schreiben 52.182

nature-writing

Manuskripte, Argumentation und Erstunterlagen auf Basis der Autorenbelege erstellen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Literatur und EvidenzIntern

Offene Volltexte

Findet rechtmäßig zugängliche Volltexte und dokumentiert Zugriff und Herkunft.

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Wissenschaftliche Grafiken 52.182

nature-figure

Wissenschaftliche Abbildungen und Mehrpanel-Grafiken mit Python/R erstellen und exportieren.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Literatur und EvidenzIntern

Lektüre und Extraktion

Extrahiert Design, Methoden und Ergebnisse mit Fundstellen im Original.

RigorMed
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Präsentation und Publikation 52.182

nature-paper2ppt

Akademische PPTX aus Artikeln oder Notizen mit Originalabbildungen und Sprechernotizen erstellen.

nature-skillsCommunityPPTPowerPoint
Yuan1z0825
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Literatur und EvidenzIntern

Zitationsbibliothek

Ordnet bibliografische Angaben, DOIs und Zitate für das spätere Schreiben.

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Präsentation und Publikation 29.269

guizang-ppt-skill

Horizontale HTML-Folien in einer Datei mit Magazin-/Schweizer Stil und Referentenansicht erstellen.

PPTPowerPoint归藏HTML
op7418
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Ideen und PlanungIntern

Themenwahl

Vergleicht Forschungsfragen, vorhandene Materialien, Machbarkeit und offene Entscheidungen.

RigorMed
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Präsentation und Publikation 10.361

dashi-ppt

Offline bearbeitbare HTML-Präsentationen aus Designs erstellen; PPTX/PDF exportieren.

PPTPowerPointDashiHTML
chuspeeism
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Ideen und PlanungIntern

Studienprotokoll

Entwickelt aus der Forschungsfrage einen Entwurf für Design, Variablen und Analyseplan.

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Präsentation und Publikation 7633

codex-ppt

Visuell einheitliche bildbasierte PPTX aus Artikeln, Berichten und Gliederungen erstellen.

PPTPowerPoint
ningzimu
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Ideen und PlanungIntern

Ethikvorbereitung

Prüft Datenherkunft, Genehmigungen und Ethikunterlagen mit offenen Punkten zur Prüfung.

RigorMed
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Dokumente & Formate 3241

image-to-editable-ppt

Screenshots, Scans und PDFs als objektweise bearbeitbare PowerPoint rekonstruieren.

PPTPowerPoint
ningzimu
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Daten und StatistikIntern

Datenqualität

Prüft Felder, fehlende Werte, Ausreißer und das Datenwörterbuch.

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Wissenschaftliche Grafiken 2775

scipilot-figure-skill

Daten untersuchen, Diagrammtypen empfehlen und mit matplotlib/seaborn/plotly lesbar darstellen.

SciPilotmatplotlib
Haojae
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Daten und StatistikIntern

Datenbereinigung

Wendet bestätigte Regeln an und bewahrt ein nachvollziehbares Bereinigungsprotokoll.

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Dokumente & Formate 5653

office-academic-skill

Chinesisch ausgerichtete akademische Word/PPT-Abläufe für Berichte, Präsentationen, Vorlagen und Layout.

PPTPowerPoint
zLanqing
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Daten und StatistikIntern

Kontrollierte Statistik

Führt einen genehmigten Analyseplan aus und exportiert Ergebnisse mit Methodenangaben.

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Literatur und Evidenz 52.182

nature-academic-search

Literaturquellen durchsuchen, Zitate prüfen und MeSH-Suchstrategien erstellen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Daten und StatistikIntern

Messwerte zusammenfassen

Fasst Messungen mit Einheiten, Gruppen und definierten Berechnungen zusammen.

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Literatur und Evidenz 52.182

nature-citation

Nature/CNS-Referenzen finden und Aussagen mit ihren Quellen verknüpfen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Daten und StatistikIntern

Metaanalyse

Synthesiert quantitative Evidenz aus Extraktionstabellen mit genehmigten Methoden.

RigorMed
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Präsentation und Publikation 52.182

nature-data

Verfügbarkeitserklärungen, Repository-Pläne und FAIR-Metadaten vorbereiten.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Wissenschaftliche GrafikenIntern

Wissenschaftliche Grafiken

Erstellt überprüfbare wissenschaftliche Abbildungen und Exportdateien aus geprüften Daten.

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Literatur und Evidenz 52.182

nature-downloader

Volltexte und Ergänzungen über OA, Verlags-APIs oder autorisierten Institutionszugang abrufen.

nature-skillsCommunity
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Wissenschaftliche GrafikenIntern

Grafische Zusammenfassung

Stellt den Forschungsablauf mit klaren Grenzen zwischen Fakten und Quellen dar.

RigorMed
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Dokumente & Formate 52.182

nature-experiment-log

Experimentbilder, Audio und Text in Markdown-Protokolle umwandeln; Feishu/Obsidian optional.

nature-skillsCommunity
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Wissenschaftliche GrafikenIntern

Konzeptillustrationen

Erstellt visuelle Konzepte für ein bestätigtes wissenschaftliches Kommunikationsziel.

RigorMed
RigorMed
Dokumente & Formate 52.182

nature-image2ppt

Folienbilder und gescannte PDFs als bearbeitbare PPTX-Objekte rekonstruieren.

nature-skillsCommunityPPTPowerPoint
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Wissenschaftliches SchreibenIntern

Manuskriptentwurf

Verbindet Protokoll, Evidenz und geprüfte Ergebnisse zu einem strukturierten Manuskript.

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Literatur und Evidenz 52.182

nature-literature-pipeline

Suche, Bewertung, Detaillektüre und Archivierung verbinden; geplantes Tracking möglich.

nature-skillsCommunity
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Wissenschaftliches SchreibenIntern

Akademische Textbearbeitung

Verbessert Ausdruck und Aufbau, ohne Bedeutung oder faktische Lücken zu verändern.

RigorMed
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Literatur und Evidenz 52.182

nature-paper-card

Lesekarten mit Methoden, Evidenz, Grenzen und Forschungsideen erstellen.

nature-skillsCommunity
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Wissenschaftliches SchreibenIntern

Literaturübersetzung

Übersetzt autorisierte Texte und prüft Begriffe, Zahlen und Aussagekraft.

RigorMed
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Wissenschaftliches Schreiben 52.182

nature-paper-to-patent

Chinesische technische Offenlegungen und Patententwürfe aus Forschungsunterlagen erstellen.

nature-skillsCommunity
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Wissenschaftliches SchreibenIntern

Zitationsformatierung

Ordnet geprüfte Zitate dem Manuskript zu und formatiert das Literaturverzeichnis.

RigorMed
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Dokumente & Formate 52.182

nature-paper-trans

Englische Artikel als chinesische Bild-PDFs übersetzen und das Layout möglichst erhalten.

nature-skillsCommunity
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Präsentation und PublikationIntern

Berichtsleitlinien prüfen

Gleicht geltende Berichtsleitlinien mit erfüllten Punkten und fehlenden Angaben ab.

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Literatur und Evidenz 52.182

nature-paper-xray

Entwurfslogik, zentrale Gleichungen und Evidenzgrenzen eines Artikels ausführlich aufarbeiten.

nature-skillsCommunity
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Präsentation und PublikationIntern

Begutachtung und Revision

Erstellt konkrete simulierte Gutachten und Überarbeitungsvorschläge für Autoren.

RigorMed
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Dokumente & Formate 52.182

nature-paper2word

Akademisches Markdown mit nativen Formeln, Tabellen, Querverweisen und Literatur in Word umwandeln.

nature-skillsCommunity
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Präsentation und PublikationIntern

Zeitschriftenwahl

Vergleicht Zeitschriften anhand des Manuskriptumfangs und offizieller Vorgaben.

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Wissenschaftliches Schreiben 52.182

nature-polishing

Akademische Texte überarbeiten, übersetzen oder kürzen, ohne Fakten und Evidenzgrenzen zu verändern.

nature-skillsCommunity
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Präsentation und PublikationIntern

Forschungspräsentation PPT

Ordnet autorisierte Materialien zu Folien mit Sprechernotizen und Quellen.

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Ideen und Planung 52.182

researchwrite

Forschungsanträge und -pläne auf Basis von Belegen verfassen, überarbeiten und prüfen.

nature-skillsCommunitynature-proposal-writer
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Präsentation und PublikationIntern

Einreichungsunterlagen

Bereitet Manuskript, Erklärungen und Checkliste für die Zielzeitschrift vor.

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Literatur und Evidenz 52.182

nature-reader

Chinesisch-englische Leseunterlagen mit Abbildungen, Tabellen, Formeln und Quellenbezug erstellen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Literatur und Evidenz 52.182

nature-ref-verifier

Autoren, Titel, Jahre, Bände, Seiten und DOIs in Literaturlisten abgleichen.

nature-skillsCommunity
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Präsentation und Publikation 52.182

nature-response

Punktweise Gutachterantworten, Revisionsbriefe und markierte Manuskripte erstellen und prüfen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Präsentation und Publikation 52.182

nature-reviewer

Simuliertes Peer-Review zu Bedeutung, Validität sowie wesentlichen und kleineren Problemen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Ideen und Planung 52.182

nature-social-science

Sozialwissenschaftliche Themen und Argumente entwickeln sowie Machbarkeit und überzogene Aussagen prüfen.

nature-skillsCommunity
Yuan1z0825
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Daten und Statistik 52.182

nature-statistics

Experimentelle Einheiten, Replikation, Tests, Unsicherheit und statistische Abbildungsangaben prüfen.

nature-skillsCommunity
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Wissenschaftliches Schreiben 5653

research-writing-skill

Chinesisch ausgerichtete Hilfe für Manuskriptentwürfe, Überarbeitung und Gutachterantworten.

research-writing-skill
zLanqing
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Daten und Statistik 5653

scientific-toolkit-skill

MATLAB/Python-Berechnungen, Signalverarbeitung, Statistik und Publikationsgrafiken verbinden.

scientific-toolkit-skill
zLanqing
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Präsentation und Publikation 187.300

pptx · Anthropic

Anthropics PPTX-Referenz für Erstellung, Bearbeitung und Vorlagen; Quellcode unter proprietären Bedingungen.

PPTPowerPointSource-available
anthropics
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Dokumente & Formate 187.300

docx · Anthropic

Anthropics Word-Referenz für Erstellung, Bearbeitung und Änderungen; Quellcode unter proprietären Bedingungen.

Source-available
anthropics
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Dokumente & Formate 187.300

pdf · Anthropic

Anthropics PDF-Referenz für Extraktion, Zusammenführung, Formulare und OCR unter proprietären Bedingungen.

Source-available
anthropics
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Dokumente & Formate 187.300

xlsx · Anthropic

Anthropics Tabellenreferenz für Bereinigung, Formeln und Diagramme unter proprietären Bedingungen.

Source-available
anthropics
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Wissenschaftliches Schreiben 187.300

doc-coauthoring · Anthropic

Anträge und Dokumente durch Kontextsammlung, Iteration und Leserprüfung gemeinsam verfassen.

doc-coauthoring
anthropics
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Wissenschaftliche Grafiken 187.300

canvas-design · Anthropic

Originelle PNG/PDF-Poster und statische Visualisierungen nach Gestaltungsprinzipien erstellen.

canvas-design
anthropics
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Dokumente & Formate 28.511

pdf · OpenAI

PDFs lesen, erstellen und Layouts prüfen; Implementierungsdetails im Quell-Repository.

pdf
openai
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Daten und Statistik 28.511

jupyter-notebook · OpenAI

Jupyter-Notebooks für Experimente, Exploration und Tutorials erstellen und strukturieren.

jupyter-notebook
openai
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Literatur und Evidenz 28.511

notion-research-documentation · OpenAI

Notion-Quellen in belegte Berichte und Vergleiche überführen; Notion-Verbindung erforderlich.

notion-research-documentation
openai
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Literatur und Evidenz 1005

qinyan-paper-search

Scholar, Wanfang, PubMed und arXiv über Qinyan OpenAPI durchsuchen; Qinyan-Schlüssel erforderlich.

QinyanRequires API key
LeonChaoX
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Literatur und Evidenz 1005

qinyan-paper-analysis

Ziele, Methoden, Ergebnisse und Grenzen über Qinyan analysieren; Qinyan-Schlüssel erforderlich.

QinyanRequires API key
LeonChaoX
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Ideen und Planung 1005

qinyan-topic-analysis

Forschungsthemen, Nutzen und Herausforderungen mit Qinyan erkunden; Qinyan-Schlüssel erforderlich.

QinyanRequires API key
LeonChaoX
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Präsentation und Publikation 6463

qiaomu-anything-to-notebooklm

Web, WeChat, PDF und Medien für Podcasts, Folien und Mindmaps in NotebookLM importieren; Konten nötig.

PPTPowerPoint
joeseesun
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Präsentation und Publikation 1235

ppt-image-first

Präsentationen im Dialog planen, visuelle Richtungen prüfen und bildorientierte Folienspezifikationen erstellen.

PPTPowerPoint
NyxTides
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Literatur und Evidenz 56.076

literature-review

Organisiert Reviews, reproduzierbare Recherchen, Auswahl und Zitationsprüfung mit dokumentierter Abdeckung.

PubMedarXiv
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 56.076

citation-management

Findet Artikel, prüft Zitationsmetadaten und erstellt wiederverwendbare BibTeX-Einträge.

DOIBibTeX
K-Dense-AI
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Wissenschaftliches Schreiben 56.076

scientific-writing

Entwirft, überarbeitet und prüft Forschungsmanuskripte mit Evidenzherkunft und Berichtsleitlinien.

IMRaD
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

statistical-analysis

Wählt statistische Methoden, prüft Annahmen und berichtet Effektstärken und Ergebnisse.

PythonR
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

exploratory-data-analysis

Untersucht unterstützte Forschungsdateien mit klar begrenzten Prüfungen auf Lücken und Ausreißer.

CSVPython
K-Dense-AI
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Wissenschaftliche Grafiken 56.076

scientific-visualization

Gestaltet wissenschaftliche Abbildungen und Mehrfeldgrafiken mit Matplotlib, Seaborn oder Plotly.

MatplotlibPlotly
K-Dense-AI
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Wissenschaftliche Grafiken 56.076

scientific-schematics

Entwirft wissenschaftliche Schemata, Ablaufpläne und Systemdiagramme mit KI und visueller Prüfung.

GeminiOpenRouter
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

scientific-slides

Erstellt Vorträge, Konferenzpräsentationen und Verteidigungsfolien mit PowerPoint oder Beamer.

PowerPointBeamerPPTslides
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

peer-review

Erstellt konkrete Gutachtenentwürfe zu Methoden, Statistik, Evidenz und Reproduzierbarkeit.

Manuscript
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

venue-templates

Bereitet Artikel, Poster und Anträge mit zielbezogenen Vorgaben und LaTeX-Vorlagen vor.

LaTeX
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

scanpy

Untersucht Einzelzell-RNA-Daten mit Qualitätskontrolle, Normalisierung und explorativer Gruppierung.

ScanpyscRNA-seq
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

biopython

Verarbeitet biologische Sequenzen und Dateien mit Biopython und NCBI-Arbeitsabläufen.

FASTANCBI
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 3400

pubmed-database

Durchsucht PubMed über NCBI und lädt Abstracts und zugängliche Volltexte.

NCBIPMC
google-deepmind
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Literatur und Evidenz 3400

openalex-search

Fragt OpenAlex-Artikel, Autoren und Einrichtungen ab und prüft DOIs und offenen Zugang.

OpenAlexDOI
google-deepmind
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Bioinformatik 3400

alphafold-analysis

Lädt AlphaFold-Vorhersagen per UniProt-Kennung und untersucht Konfidenz und Domänen.

AlphaFoldUniProt
google-deepmind
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Wissenschaftliches Schreiben 14.258

ml-paper-writing

Strukturiert Argumente, Zitate und Konferenzmanuskripte für maschinelles Lernen.

NeurIPSICML
Orchestra-Research
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Wissenschaftliche Grafiken 14.258

academic-plotting

Erstellt akademische Datengrafiken und Architekturdiagramme aus Ergebnissen und Beschreibungen.

MatplotlibGemini
Orchestra-Research
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Ideen und Planung 14.258

research-ideas

Erkundet Forschungsrichtungen mit strukturierten Ansätzen zur Problemfindung und zum Vergleich.

Research
Orchestra-Research
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Ideen und Planung 14.258

creative-thinking

Nutzt Analogien, neue Problemrahmen und geänderte Einschränkungen für Informatik- und KI-Ideen.

CSAI
Orchestra-Research
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KI-Forschung 14.258

llm-evaluation

Vergleicht Sprachmodelle mit standardisierten Aufgaben, Einstellungen und dokumentierten Messwerten.

MMLUHumanEval
Orchestra-Research
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Ideen und Planung 56.076

experimental-design

Designs experiments and studies BEFORE data is collected — choosing a design, randomizing, blocking, and laying out treatment combinations so results are interpretable.

experimental-design
K-Dense-AI
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Ideen und Planung 56.076

statistical-power

Calculates sample sizes and statistical power for study planning.

statistical-power
K-Dense-AI
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Ideen und Planung 56.076

hypothesis-generation

Formulates evidence-bounded scientific questions, candidate hypotheses, rival explanations, causal or associational claims, discriminating predictions, measurements, and preregistration-ready analysis plans.

hypothesis-generation
K-Dense-AI
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Ideen und Planung 56.076

scientific-brainstorming

Facilitates evidence-aware scientific ideation with independent generation, structured discussion, explicit assumptions, transparent evaluation, adversarial review, and decision logs.

scientific-brainstorming
K-Dense-AI
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Ideen und Planung 56.076

scientific-critical-thinking

Evaluates scientific claims and evidence quality.

scientific-critical-thinking
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

research-grants

Supports research proposal preparation and review for NSF, NIH, DOE, DARPA, and Taiwan NSTC, including opportunity-specific requirements, aims, review criteria, budgets, broader impacts, forms, and resubmissions.

research-grants
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

scholar-evaluation

Provides qualitative-first, evidence-traceable developmental review of scholarly works and audit low-stakes research-assessment rubrics with optional local quality controls.

scholar-evaluation
K-Dense-AI
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Wissenschaftliche Grafiken 56.076

matplotlib

Creates and customizes scientific plots with Matplotlib.

matplotlib
K-Dense-AI
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Wissenschaftliche Grafiken 56.076

seaborn

Creates Seaborn statistical visualizations with pandas integration for distributions, relationships, categorical comparisons, regression displays, pair plots, and heatmaps.

seaborn
K-Dense-AI
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Wissenschaftliche Grafiken 56.076

infographics

Creates and reviews infographics with Nano Banana 2 via OpenRouter.

infographics
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

latex-posters

Creates research posters in LaTeX using beamerposter, tikzposter, or baposter.

latex-posters
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 56.076

pptx-posters

Creates and audits editable scientific posters in macro-free PowerPoint (.pptx) from author-approved local content and assets.

pptx-postersPPTPowerPointslides
K-Dense-AI
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Dokumente & Formate 56.076

markitdown

Converts heterogeneous documents and selected URIs to Markdown with Microsoft MarkItDown for text analysis, search, and LLM/RAG ingestion.

markitdownPPTWordExcelPDF
K-Dense-AI
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Dokumente & Formate 56.076

markdown-mermaid-writing

Writes scientific Markdown documentation and Mermaid diagrams for workflows, relationships, timelines, and schemas.

markdown-mermaid-writing
K-Dense-AI
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Dokumente & Formate 56.076

liteparse

Local document and PDF parsing that returns spatial text with bounding boxes.

liteparsePDFWordOCR
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 56.076

pyzotero

Manages Zotero reference libraries using the pyzotero Python client: retrieves, creates, updates, and deletes items, collections, tags, and attachments via the Zotero Web API v3 or local API.

pyzotero
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 56.076

open-notebook

Organizes research with the self-hosted Open Notebook alternative to NotebookLM.

open-notebook
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 56.076

database-lookup

Queries documented public database APIs with explicit endpoints, filters, pagination, and provenance.

database-lookup
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 56.076

paper-lookup

Searches 18 scholarly APIs for papers, preprints, citations, open-access full text, repository records, and journal OA status, and returns results with reproducible provenance.

paper-lookup
K-Dense-AI
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Literatur und Evidenz 56.076

research-lookup

Compiles current scholarly evidence for a scientific manuscript or research brief when the user explicitly asks to gather literature, references, background evidence, competing findings, or a manuscript research packet.

research-lookup
K-Dense-AI
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Ideen und Planung 56.076

protocolsio-integration

Reads, validates, and safely exports protocols.io data with current official REST/MCP contracts, or creates non-executing mutation plans.

protocolsio-integration
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

statsmodels

Fits and diagnoses Python statistical models including OLS, GLM, discrete and mixed models, ARIMA and SARIMAX.

statsmodels
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

pymc

Builds and checks Bayesian models with PyMC, including hierarchical models, NUTS MCMC, variational inference, mutable-data predictions, posterior predictive checks, diagnostics, and PSIS-LOO model comparison.

pymc
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

scikit-survival

Builds, evaluates, and audits right-censored or competing-risk survival workflows with scikit-survival, including leakage-safe preprocessing, model selection, probability prediction, and censoring-aware metrics.

scikit-survival
K-Dense-AI
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KI-Forschung 56.076

scikit-learn

Supports machine learning in Python with scikit-learn.

scikit-learn
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

networkx

Creates, analyzes, and visualizes complex networks and graphs in Python with NetworkX.

networkx
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

sympy

Performs exact symbolic mathematics with SymPy for algebra, calculus, equation solving, symbolic linear algebra, physics, and lambdify or LaTeX code generation.

sympy
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

polars

High-performance DataFrame library for Python ETL, analytics, and pandas migration.

polars
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

dask

Scales pandas, NumPy, and custom Python research workflows beyond memory or across clusters with Dask.

dask
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

vaex

Processes large tabular scientific datasets with Vaex expressions, filtered views, streamed statistics, binned visualizations, and file conversion.

vaex
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

matlab

Builds, reviews, migrates, and plans MATLAB or GNU Octave numerical workflows.

matlab
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

uncertainty-and-units

Tracks physical units and propagates measurement uncertainty in scientific calculations using pint and uncertainties.

uncertainty-and-units
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

anndata

Handles annotated matrices in single-cell analysis, .h5ad and Zarr files, and integration with the scverse ecosystem.

anndata
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Bioinformatik 56.076

scvi-tools

Fits probabilistic models for single-cell omics, including scVI batch integration, scANVI annotation, totalVI CITE-seq, MultiVI RNA/ATAC integration, and posterior differential expression.

scvi-tools
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Bioinformatik 56.076

scvelo

Performs RNA velocity analysis with scVelo from spliced and unspliced single-cell RNA counts.

scvelo
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

pydeseq2

Performs bulk RNA-seq differential expression analysis with PyDESeq2, including count validation, formula designs, explicit contrasts, Wald tests, FDR correction, coefficient-matched LFC shrinkage, and result visualization.

pydeseq2
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Bioinformatik 56.076

bulk-rnaseq

Prepares bulk RNA-seq FASTQ, Salmon, STAR or featureCounts output for gene-level differential expression.

bulk-rnaseq
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

pathway-enrichment

Performs pathway and gene-set enrichment analysis on gene lists or ranked gene data and interprets the results.

pathway-enrichment
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KI-Forschung 56.076

deepchem

Builds molecular property prediction and MoleculeNet workflows with DeepChem, including SMILES featurization, scaffold or grouped holdouts, masked labels, graph models and explicit pretrained encoder transfer.

deepchem
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

diffdock

Predicts protein-small-molecule binding poses with DiffDock and DiffDock-L from PDB or sequence plus SMILES/SDF/MOL2.

diffdock
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

medchem

Applies medicinal chemistry filters for compound triage, using drug-likeness rules (Lipinski, Veber, CNS), structural alert catalogs (PAINS, NIBR, ChEMBL), complexity metrics, and the medchem query language for library filtering.

medchem
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

datamol

Pythonic wrapper around RDKit with simplified interface and sensible defaults.

datamol
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

cellprofiler

Runs reproducible CellProfiler microscopy pipelines for nuclear segmentation, cell counts, and per-object fluorescence measurements.

cellprofiler
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

histolab

Extracts and preprocesses whole-slide histology image tiles with Histolab.

histolab
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

pydicom

Reads, inspects, writes, transforms, and preflights local DICOM datasets and pixel data.

pydicom
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

neurokit2

Builds and audits reproducible NeuroKit2 research workflows for physiological time-series preprocessing, event/interval analysis, multimodal alignment, variability, and complexity.

neurokit2
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

flowkit

Analyzes flow cytometry data with FlowKit, including spillover compensation, logicle and biexponential transforms, hierarchical gating, GatingML strategies, and supported FlowJo 10 workspaces.

flowkit
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

qiime2-amplicon

Processes paired-end 16S amplicon reads into QIIME 2 ASVs and taxonomy with retained artifact provenance.

qiime2-amplicon
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

nextflow

Builds, runs, and debugs Nextflow DSL2 pipelines and nf-core workflows.

nextflow
K-Dense-AI
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Bioinformatik 56.076

lamindb

Manages biological datasets and models with LaminDB, including artifact registration, lineage tracking, schema validation, Bionty ontology annotation, query/search, collections, branches, storage, and workflow integrations.

lamindb
K-Dense-AI
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Daten und Statistik 56.076

zarr-python

Stores and queries chunked N-D scientific arrays with Zarr-Python 3, including codecs, sharding, S3/GCS storage, and NumPy/Dask/Xarray integration.

zarr-python
K-Dense-AI
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Präsentation und Publikation 14.258

presenting-conference-talks

Generates conference presentation slides (Beamer LaTeX PDF and editable PPTX) from a compiled paper with speaker notes and talk script.

presenting-conference-talksPPTPowerPointslides
Orchestra-Research
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Literatur und Evidenz 3400

literature-search-arxiv

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